日升月落，日月轮转间，不知不觉一万年过去了。期间，万寿山发生了极大变化，山上灵草、灵花、灵木种类更多了，山间宫宇殿落、轩榭阁楼、亭台祭坛、连廊望楼、玉梯石桥更加大气精美了。
原来红云闭关五千就出关了，在天地奇珍黄中李果实辅助之下，伤势已经完全恢复，修为更是突破到罗天上仙圆满。
随后五千年，红云时而修炼，时而指导万寿山一脉众仙修行，时而重新炼制万寿山建筑群，也是颇为繁忙。这也是红云不想闲下来，因为一闲下来，就担心大哥镇元子的伤势，索性就忙起来算了。
各种灵植吐纳先天灵气反哺大地，建筑群构建的山海胎膜大阵每时每刻从虚空吞吐海量先天灵气，亦是滋润着万寿山及其附近灵脉，因此大战中受损的万寿山灵脉恢复速度极快，估计即使没有大阵帮助，大约再过万年便可恢复如初了。
万寿山一脉众仙修为也有了极大突破，首先是大弟子石岳、黑白双蛇太乙玄仙圆满，其次是二弟子石炎、三弟子石淼、六弟子石鑫、寻宝灵兽太乙玄仙后期，老幺石灵杉和其他二十五个弟子分布太乙玄仙中期至初期，清风与明月太乙初期。
众仙按照镇元子闭关之前的吩咐，在这万年间，以万寿山为起点逐步蚕食周边山川河流，暂时目标是控制住方圆八百万里内。同时，把地盘内一些本性善良或者善于争斗的种族收服并加以调教，用之辅助万寿山一脉控制地盘内的灵脉宝地。
在降服的种族中，比较有潜力的是牛族、虎族、马族、鹿族、灵鹫族，这五族也被委以重任，分别负责万寿山东、西、南、北、中五个方向地盘内灵脉宝地的管理和守护。
万寿山灵蛇一族，在万年间基本上把地下方圆八百万里水系牢牢控制在手，比起地面其他五族联手进展都要快。
原因自然是灵蛇一族早早就投靠万寿山，本来在方圆八百万里地下水系中就属于强大种族，又有黑白双蛇带领冲锋陷阵，一统地下水系非常顺利。
此次万寿山一脉之所以能够非常顺利一统万寿山附近方圆八百万里地上、地下山川河流，是因为如今洪荒地大物博、生灵稀少，大道掌控天地，大道法则晦涩深奥、难以参悟，而天道还在孕育中、暂未苏醒，洪荒百族还没有到发展的黄金时期。
要是到天道苏醒后，天道长河显世千年，期间得益于天道馈赠，洪荒百族会从中参悟很多适合本族和自身的修炼功法、神通、秘术，甚至法则等，从那以后洪荒百族会有一个大发展、大繁荣的时期，估计龙凤麒麟三祖在那不久就会建立族群。
如果那个时候再扩张万寿山地盘，估计绝对不会如此顺利了。镇元子也是自身实力马上突破大罗金仙，又看准了时机，趁着这个空档时期扩张最为妥当，才会在闭关前如此安排。
在这万年间，不但万寿山变化极大，镇元子也是如此。
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