允熥当然不理，而且心里还有些纳闷：‘昀芷与无忌先是一同为印度三总督之一，现下又一并掌管北平府和宣府镇，你们怎么就视而不见，只盯着敏儿呢？’但不论文官们为何如此，他都不会在敏儿掌管格致院这件事上让步。文官们进谏了一阵，见宫里没有反应，也只能偃旗息鼓，承认现实。
与此同时，改造日本之事也在秘密进行。文垣重新回到理番院为副使，光明正大地盯着日本的一举一动，准备在有机会的时候动手。
已经成为大明总后勤部尚书、大都督府朱雀阁会议成员之一的朱恒实当然也卷入其中。不仅仅是因为官职，允熥已经向他许诺，若是谋划成功，就让他恢复原日本皇族身份，让他的子孙成为日本国王。面对如此诱惑，朱恒实当然竭尽全力为大明谋划。
另一个卷入此事的原大明番国宗室同样十分高兴地参与起来。今年四十五岁的黎元澄此时为总参谋部左侍郎，负责谋划在必要时出兵日本的作战方案。他或许是本着自己的国家完蛋了，也不让别的番国好过的想法，殚精竭虑思量作战方案，而且随时根据日本本土的变动进行修改。
经过十年的谋划，终于让文垣等到了机会。建业三十年，足利义持病逝。他去世前自己的儿子已经死去三年，因此在重病后急需定下继承人；但足利义持不知为何，拒绝指定继承人。群臣经过商议，决定在石清水八幡宫以抽签的方式选出新任将军。义持死亡后，由他的四个弟弟梶井义承、大觉寺义昭、虎山永隆和义圆在石清水八幡宫抽签。群臣认为抽签代表了神的旨意，是最公正的方式。最后抽出来的人选是义圆。
但义圆这个人比较特殊。他曾经做过和尚，日本还没有曾经做过和尚的大将军，再加上他若是继承大将军之位还会违背许多其他规矩，因此有很多人反对。日本的局势很不稳定。
历史上，义圆先后两次改名，而且一年多后才正式加封征夷大将军，日本的局势才稳定下来。但这个时空，文垣没有给他局势稳定下来的机会，利用横滨的永安王朱孟炯笼络过来的关东大名，以及第四代镰仓公方足利持氏，成功推翻幕府，罢黜了义圆。
但文垣又有意削弱足利持氏的权威，让日本始终不能安定。过了几年，他认为时机完全成熟了，让朱恒实恢复南朝皇子身份，命关东的大名拥戴原恒实亲王。又经过一场战争后，足利持氏兵败自杀，恒实成为日本的统治者。
但他夺取日本政权后没过几个月就病逝了，长子则在之前的战争中阵亡。所以恒实年仅十六岁的长孙睦仁继承了他的位置。睦仁从小在大明长大，深受大明儒家教诲，认为大明这样强大，完全向大明臣服理所应当，也是对日本做好的做法。睦仁彻底废除天皇，自任国王，改革日本的制度，向大明靠拢。不过日本的传统势力很强，他一时半会儿还不可能将日本变得与大明一样。
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