在此期间，京极胜秀的另外一个儿子乙童子丸（京极高清）被西军大佬六角高赖拥立，加入了西军阵营。京极政经一方被西军逐出了近江，逃亡出云。
此后，京极家一分为二（史称京极sao乱）。
文明18年，京极政经从出云上洛，然后暗中联络了京极高清的家臣多贺宗直，在近江掀起了叛乱。当时京极高清的正室是隔壁美浓守护代斋藤妙纯的女儿，所以京极高清得到了斋藤家的支援。
最终这场内乱以京极高清的胜利而告终。但是也因为这场内乱，致使京极家走向衰落，出云也被尼子家窃取，飞驒也落入他人之手。最终，只剩下北近江半国的领地。
到了今天，京极家再次爆发内乱。内乱的原因可以归结为了俩点。
第一，是京极高清专宠家臣上坂信光，造成了京极家家臣的不满。其二，便是京极高清不喜长子京极高广，而想要立次子京极高吉为继承人，
于是不满京极高清的家臣们与京极高广串通起来，发动了这场历时一年的内乱！而到了今天，这场内乱似乎也快要结束了！
上平寺城外，京极高广本阵内。
一揆总大将京极高广看完手中这封刚刚从城内传出来的书信之后，长长的松了口气。信是京极高清亲笔所写，大意是三郎法师和琴川夫人现在十分安全，若是京极高广能答应放京极高清、京极高吉父子一条生路的话，那么就将三郎法师和琴川夫人安全的交到京极高广的手中。
“诸位，父亲大人刚刚来信，言明只要在下能放父亲大人和长门守（京极高吉）离开，便能保我妻子无恙！”京极高广将手中的信件摊开，如释重负的说道。
琴川夫人真名为阿琴，是京极家臣赤尾氏出身。听到京极高广的话之后，赤尾家当主赤尾清世也长松了一口气，“阿姊没事便好！”
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